Jõelähtme kirik on üks Eesti vanimaid kirikuid. Algne puust kirik rajati taanlaste vallutusperioodil 1220-ndate algul. Kirjalikes allikates mainitakse esmakordselt Jõelähtme Neitsi Maarjale, Jeesuse emale, pühitsetud kirikut 1241. aastal ning keskaegse läänisüsteemi alusel kuulus see Tallinna Toomkirikule. Tõenäoliselt pühitseti kirik algselt juba 1220. a. augustikuu 15. päeval ehk Neitsi Maarja uinumispühal. Nii sai Maarja kohaliku rahva eestkostjaks ja kaitsjaks.
Praeguse väljanägemise on kirik saanud kolmes hilisemas suuremas etapis. Säilinud on 1639. aastal valminud renessanss-stiilis kantselei ja 1670.a. valminud barokkaltar. Kirikus asub ka Harjumaa vanim kirikukell.
1984. aastal toimusid siin filmi “Hundiseaduste aegu” võtted.