Jõelähtme kirik on üks Eesti vanimaid kirikuid. Algne puust kirik rajati taanlaste vallutusperioodil 1220-ndate algul. Kirjalikes allikates mainitakse esmakordselt Jõelähtme Neitsi Maarjale pühitsetud kirikut 1241. aastal ning keskaegse läänisüsteemi alusel kuulus see Tallinna Toomkirikule.
Praeguse väljanägemise on kirik saanud kolmes hilisemas suuremas etapis. Säilinud on 1639. aastal valminud renessanss-stiilis kantselei ja 1670.a. valminud barokkaltar. Kirikus asub ka Harjumaa vanim kirikukell.
1984. aastal toimusid siin filmi “Hundiseaduste aegu” võtted.