Äksi kirikukihelkonda on kirjalikes allikates esmamainitud 1443. aastal. Praegune kirikuhoone on tõenäoliselt ehitatud 1770. aastal, aga selle vanimad osad umbes 1500. aastast – samas asukohas on varem olnud mitu puust kirikut, mis on aga sõdades hävinud.
Kirik rekonstrueeriti põhjalikult uusgooti stiilis 19. sajandi lõpus.
Kirikuaias on mälestuskivi 1815–1832 Äksis pastoriks olnud keelemees Otto Wilhelm Masingule (1763–1832)
Äksi kiriku orel on valmistatud Frankfurdis orelimeister Saueri käe all ja on kirikus aastat 1905.